第一弾のほんとうのストーリー
第１話『撲殺天使だよ！ドクロちゃん！』
いたって平凡な中学二年生の少年・草壁桜（くさかべ さくら）のもとに、一人の天使がやってきました。彼女の名前は「撲殺天使ドクロちゃん」!? ドクロちゃんは桜くんが大好きなあまり、ことあるたびにその手にもつ、棘付きバット「エスカリボルグ」で撲殺して……。
──これは桜くんとドクロちゃんの愛と希望と流血のハートウォーミングストーリーです。
第２話『未来からの刺客だよ！ ドクロちゃん！』
桜くんが通う学校『聖ゲルニカ学園』にまでついてきちゃったドクロちゃん。彼女の外見（だけ）はとっても可愛いので、クラスの人気者になります。なんとも複雑な気分の桜くん。そんな彼のもとに、もうひとりの天使・サバトちゃんがやってきて……！
──誉れ高き貧乏天使、サバトちゃん登場です。
第３話『恋のキューピットだよ！ ドクロちゃん！』
桜くんのおさなじみで、クラスのアイドル・水上静希（みなかみ しずき）ちゃんが、桜くんにお願いがあるとやってきました。静希ちゃんの友達・ちえりちゃんと桜くんの友達・宮本の仲をとりもって欲しいということです。静希ちゃんの頼みとあれば、断るわけにはいきません。でもドクロちゃんもついて来ちゃって……!?
第４話『ニューシネマパラダイスだよ！ ドクロちゃん！』
なんと！ 今日は桜くんと静希ちゃんのデートの日。一緒に映画を見に行く約束をしていたのですが、ドクロちゃんが「桜くんのにおい」をたどって一緒に遊ぶはめになってしまいます。さらに、サバトちゃんや、モヒカン（変態）天使・ザンスまで映画館に現れて……！
第５話『林間学校だよ！ ドクロちゃん！』
林間学校にやってきたゲルニカ学園の生徒たち。桜くんも山での生活をエンジョイしていたのですが、小川での自由時間では、みんなの水着姿がまぶしくて、平常心でいられません。そしてはじまる、謎のカレーパーティ!?
──南さん、そんなににらまないで！
第６話『肝だめしだよ！ ドクロちゃん！』
林間学校の夜といえば、もちろん肝だめし！ 桜くん＆ドクロちゃんペアもおそるおそるゴールである神社を目指しますが、謎の生き物やドクロちゃんの怖い話で桜くんはびくびくしっぱなし！ そんな中、静希ちゃんが山の中で迷子になってしまいます。桜くんが捜しにいったそのさきに待ち受けていたモノは……！
第７話『ザクロちゃんだよ！ドクロちゃん！』
ドクロちゃんの仕業で５時間目の体育は自習になりました。そこでおもむろに始まったのは、呪われた遊戯“ポックリさん”。嫌がる桜くんを尻目に、次々と暴かれる桜くんの深層心理!? そこに突然ドクロちゃんの妹・撲殺天使ザクロちゃんが現われて・・・・・・。
──「未来に帰りましょう、おねえさま。」
第８話『さようならだよ！ドクロちゃん！』
ザクロちゃんの持つ魔法のアイテム・殺人濡れタオル『エッケルザクス』により、拘束されたドクロちゃん（と、ついでに桜くん）は、未来の世界へ無理矢理連れ戻されそうになってしまいます。桜くんは、そこでようやく、撲殺娘に対する自分の気持ちに気付くのでした。
桜くんが出した答えとはいったい!?
そして、第二期シリーズへつづく…